Le choeur de l'église est la partie la plus ancienne, bâti vers la fin du XVème ou début du XVIème siècle. Il aurait servi de chapelle à l'Abbaye de Saint-Josse. Les armes du monastère et celles de son abbé Mathieu de La Warenne y sont toujours visibles aujourd'hui. Dans le montreuillois, Saint-Josse est très honoré par les marins. C'est la raison pour laquelle de nombreuses immatriculations du bateau sont gravées sur ses murs extérieurs.